Историческая справка

        1 сентября 1962 года, по адресу: г. Калининград, Октябрьская площадь, 36 была открыта, восьмилетняя школа №46 Балтийского района г. Калининграда. Здание приходилось делить со школой №3. Нашей школе досталось 6 классных комнат на первом этаже и три классные комнаты на четвёртом. Первым директором школы стала Грошева Олимпиада Фёдоровна.

      В 1968 году    восьмилетняя     школа   №46      становиться средней (приказ ГОРОНО № 346 от 28 июня 1968 года) и получает только что построенное школьное здание по адресу: г. Калининград, улица Летняя, 48.
С 1977 по 1988 г. школу возглавляет Штукатурова Римма Васильевна, в 1988-1989 Голышева Лариса Викторовна. В 1989 году директором школы стала Демачёва Наталья Викторовна, которая руководила школой до 2018 года
    На основании приказа № 492 от 30.06.2004 года Управления образования мэрии города Калининграда к МОУ СОШ № 46 с углубленным изучением отдельных предметов была присоединена реорганизованная основная школа № 42 города Калининграда. Здания 42-й школы   были построены в 1891 году, а размещалась в них школа имени великого итальянского педагога Песталоцци.
   В послевоенный период в одном из них находился районный дом пионеров, а в другом      общеобразовательная      школа.
        В настоящее время образовательное учреждение возглавляет Крукле Владлена Анатольевна.
Сегодня в МОУ СОШ № 46 с углубленным изучением отдельных предметов обучается более 1700 учеников.
   Всего за время работы школы среднее образование получил 3541 учащийся. Из них окончили с «Золотой медалью» - 102 ученика, с «Серебряной медалью»–286.